メダカ

メダカは、世代時間が約3か月と短く、小型で飼育も容易です。またゲノムサイズは約800Mbpで、高精度な全ゲノム配列やゲノムアノテーションも整備されています。メダカは生息温度域や生息塩分濃度域が広いという生理学的な特性もあります。さらに、東南アジアを中心に様々な環境に適応した近縁種も利用できます。初期胚の操作に必須な孵化酵素も提供しています。

リソースの系統

・標準系統及び日本産、中国産、韓国産野生由来系統：約100系統
・突然変異系統及び遺伝子導入系統：約730系統
・近縁種：約10系統
・ゲノムリソース（cDNA, BAC, Fosmidクローン）：約73万クローン
・孵化酵素

リソースの特徴

NBRP Medakaは世界規模で展開する唯一のメダカ生物遺伝資源センターです。生体リソース、ゲノムリソース、孵化酵素に加え様々なリソースのデータベースを提供しています。

代表機関での取り組み

基礎生物学研究所と宇都宮大学は東北大学と協力して野生由来系統のゲノム塩基配列を決定をします。またPacBio Hi-Fi readsを用いてより精度の高いリファレンスゲノムを構築します。

分担機関での取り組み

メダカ生命情報及びオミクスデータの統合に向けて、国立遺伝学研究所を中心に、利便性の高いウェブツールの開発に取り組んでいます

リソース関連プログラム課題

【ゲノム情報等整備／ゲノム情報等整備プログラム】

【基盤技術整備／基盤技術整備プログラム】